Le Règlement sur les produits biologiques, 2009, n'exige pas que l'abattoir soit certifié; cependant, l'abattage doit être exécuté en conformité avec la norme CAN/CGSB 32.310 (norme biologique du Canada).
L'abattoir doit tenir un registre des procédures d'abattage pour attester que l'intégrité biologique du produit a été maintenue. Ce registre doit être transmis à l'organisme de certification de l'opérateur/fermier pour qu'il vérifie que l'abattage a été effectué conformément à la norme. Le détenteur du certificat de conformité à la norme biologique est responsable de la mise à jour de ce registre.
Si les opérations d'abattage, d'emballage et d'étiquetage sont inclues dans la procédure de certification biologique du produit, l'organisme de certification doit vérifier que ces opérations sont conformes à la norme biologique. Si tel est le cas, les abattoirs ne sont pas tenus d'exiger une certification distincte pour les opérations d'emballage et d'étiquetage de la viande.
Si le certificat de conformité biologique inclut uniquement la vérification des opérations menant à l'étape de l'abattage, et que l'abattoir procède par la suite à l'emballage et à l'étiquetage du produit, ces opérations d'emballage et d'étiquetage effectuées à l'abattoir doivent être certifiées.